种公猪精液中与繁殖障碍有关的6种病毒的检测(二)
发布: 2010-04-03 | 作者: 孙泉云1,周锦萍1,张维谊1,曹建国2, | 来源: 现代化养猪信息网
(1.上海市畜牧兽医站,上海 201103;2.上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海 201106)
1.2.2 病毒RNA 的提取
取待检样品200 μL,加入600 μL Trizol试剂,颠倒混匀;再加入200 μL三氯甲烷,颠倒混匀,室温放置5 min,12 000 r/min离心15 min;取500 μL上清置于新的经DEPC水处理过的 1.5 mL灭菌离心管中,加入500 μL预冷的异丙醇,颠倒混匀,室温放置5 min,12 000 r/min 离心15 min;轻轻弃上清,倒置于吸水纸上,加入预冷的700 μL浓度为750 mL/L乙醇,颠倒洗涤,12 000 r/min 离心5 min~10 min;弃上清,将离心管倒扣于吸水纸上1 min,短暂离心,用微量加样器吸干残液;室温干燥3 min~5 min(以无乙醇味为准),加入10 μL~30 μL DEPC水,轻轻混匀,溶解RNA,置-20 ℃保存备用。
1.2.3 病毒DNA的提取 取待检匀浆上清液250 μL,加500 μL buffer V-A混匀,室温静置5 min;加125 μL buffer AP2,和125 μL buffer V-B,颠倒混匀;12 000 r/min离心5 min,取850 μL上清于装有柱子的2 mL离心管中;5 000 r/min离心1 min,弃废液,加700 μL buffer W1A;6 000 r/min,离心1 min,弃废液,加700 μL buffer W2漂洗液;12 000 r/min离心1 min,弃废液,加700 μL buffer W2漂洗液;12 000 r/min离心1 min,将柱子套入一新的1.5 mL管,加40 μL buffer TE;室温放置1 min,12 000 r/min离心1 min;管中收集的即为提取的病毒DNA,置-20 ℃保存备用。
1.2.4 6种疫病的PCR反应体系、反应条件和结果判定
1.2.4.1 PRV检测
设计引物,扩增猪伪狂犬病病毒基因中434~651碱基对(bp)之间217 bp片段。引物序列为上游引物P1:5′-CAG GAG GAC GAG CTG GGG CT-3′; 下游引物P2:5′-GTC CAC GCC CCG CTT GAA GCT-3′。
PCR反应体系为10×PCR buffer(含MgCl2 )2.5 μL,dNTPs(2.5 mmol/L) 2.0 μL,引物(25 pmol/μL)各1 μL,TaqDNA聚合酶(5 U/μL) 0.5 μL,DNA模板4.0 μL,加双蒸水至25 μL。PCR反应条件为:94 ℃ 3 min;94 ℃ 1 min,65 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,40个循环;72 ℃ 5 min。取5 μL PCR产物在11 g/L的琼脂糖凝胶上进行电泳(100 V,30 min),在凝胶成像系统上观察目的片段。
1.2.4.2 PCV检测 设计引物,其序列为上游引物P1:5′-CCG CGGGCTGGCTGAACTT-3′; 下游引物P2:5′-ACCCCCGCCACCGCTACC-3′;预期扩增片段大小为1 154 bp。
PCR反应体系为:10×PCR buffer(含MgCl2 )2.5 μL,dNTPs(2.5 mmol/L) 2.0 μL,引物(25 pmol/μL)各1 μL,TaqDNA聚合酶(5 U/μL) 0.5 μL,DNA模板4.0 μL,加双蒸水至25 μL。
PCR 反应条件为:94 ℃ 5 min;94 ℃ 1 min,53 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min, 35个循环;72 ℃ 7 min。取5 μL PCR产物在11 g/L的琼脂糖凝胶上进行电泳(100 V 30 min),在凝胶成像系统上观察目的片段。
1.2.4.3 PPV检测 PCR反应体系为总体积20 μL。取16 μL PCR反应液、2 μL TaqDNA聚合酶、2 μL模板DNA混匀。PCR 反应条件为:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35个循环;72 ℃ 7 min。取5 μL PCR产物在11 g/L的琼脂糖凝胶上进行电泳(100 V,30 min),在凝胶成像系统上观察目的片段。预扩增片断大小为313 bp。
1.2.4.4 JEV检测 PCR反应体系:每份总体积25 μL。取RT-PCR反应液21.5 μL,RNA酶抑制剂0.3 μL,反转录酶0.2 μL,TaqDNA聚合酶1 μL,模板RNA 2 μL。RT-PCR 反应条件:42 ℃ 45 min;94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35个循环;72 ℃ 5 min。取5 μL PCR产物在11 g/L的琼脂糖凝胶上进行电泳(100 V,30 min),在凝胶成像系统上观察目的片段。预扩增片断大小为375 bp。
1.2.4.5 CSFV和PRRSV检测
反应体系为每2个样品需要个1酶球、40 μL RT-PCR反应液,计算好各试剂的使用量,加入适当体积的试管中,充分混匀